https://www.genetica.cz
+420 272 701 055
Služeb 4
Praha
1.png)
.png)
.png)
.png){kind=logo}
BaseSpace Sequence Hub - Illumina
Prostor pro vaše sekvenační data
BaseSpace Sequence Hub je cloudové prostředí pro analýzu, ukládání a sdílení genomických dat. Streamujte data přímo ze svého sekvenačního experimentu a poté analyzujte své výsledky pomocí aplikací BaseSpace Sequence Hub.
Hlavní výhody účtu na BaseSpace Sequence Hub
- Monitorování sekvenačního experiementu v reálném čase, odkudkoliv
- Automatický upload dat a tvorba FASTQ po skončení sekvenace
- Snadné sdílení dat se spolupracovníky nebo zákazníky
- Jednoduchá analýza dat pomocí DRAGEN aplikací
- Přístup k demo datům Illuminy
Registrace a typy účtů
- Základní verzi BaseSpace Sequence Hub je možné využívat zdarma. Tato veze poskytuje 1TB bezplatného úložiště a automatickou tvorbu FASTQ po skončení sekvenace. Stačí se zaregistrovat zde kliknutím na „Don’t have an account“.
- Po registraci získáte na prvních 30 dní 250 iCreditů, které můžete využít například na vyzkoušení analýzy pomocí BaseSpace Sequence Hub aplikací.
- Pokud se po 30 dnech rozhodnete dál využívat BaseSpace pro ukládání většího množství dat nebo pro využívání aplikací, je nutné přejít na Professional nebo Enterptise účet, v rámci kterého lze nakupovat iCredity.
| Basic | Professional | Enterprise | |
|---|---|---|---|
| Zahrnuté úložiště zdarma | 1 TB | 1 TB | 1 TB |
| Zahrnuté iCredity | 250* iCreditů |
500 iCreditů | 500 iCreditů |
| Možnost platby za iCredity | n/a | měsíční fakturace nebo předplacení | měsíční fakturace nebo předplacení |
| Nastavení experimentu | ano | ano | ano |
| Monitoring experimentu | ano | ano | ano |
| Stahování dat | zdarma | zdarma | zdarma |
| Sdílení dat | ano | ano | ano |
| Pokročilé zabezpečení a soulad s ISO 27001, ISO 27701, ISO 13485 | ano | ano | ano |
| API přístup | ano | ano | ano |
| Přístup z příkazového řádku | ano | ano | ano |
| Počet užívatelů | jeden | neomezený | neomezený |
| Počet pracovních skupin | jedna | neomezený | |
| Prvotřídní zabezpečení (soukromá doména, kontrola nad přístupy, auditní stopa) | ano | ||
| Cena | bezplatný | cena na vyžádání | cena na vyžádání |
* Platnost iCreditů je 30 dní
iCredit
Co je to iCredit?
iCredit je měna používaná k nákupu úložiště a výpočetního času na Illumina cloudových platformách jako jsou BaseSpace Sequence Hub a Illumina Connected Analytics.
V BaseSpace Sequence Hub je u každé aplikace uvedena cena v iCredits za node hour – kolik za analýzu zaplatíte se tedy odvíjí od doby, po kterou analýza poběží.
Kolik iCreditů budu potřebovat?
Tyto příklady vám pomůžou naplánovat, kolik iCreditů si musíte zakoupit, abyste mohli ukládat svá data nebo používat běžné aplikace.
Úložiště
| Kategorie | iCredity za TB za měsíc |
|---|---|
| Standardní úložiště | 22,50 |
| Archivní úložiště | 2,00 |
Jednoduše řečeno, pokud budete mít po celý měsíc ve standardním úložišti 1 TB dat (přibližně osm 30x lidských WGS), zaplatíte 22,5 iCreditů. Pokud víte, že s daty už nebudete v blízké době pracovat (stahovat je, analyzovat) a chcete je pouze dlouhodobě archivovat, je lepší je přesunout do archivního úložiště, kde 1 TB dat za měsíc stojí pouze 2 iCredity. S přesunem dat do archivu a z archivu se také pojí poplatek, proto archivujte pouze když víte, že data nebudete nějakou dobu využívat.
| Kategorie | iCredity za přesun 1 TB |
|---|---|
| Přesun ze standardního do archivního úložiště | 20 |
| Přesun z archivního do standardního úložiště | 30 |
Odhad nákladů za analýzy
Kolik stojí zpracování jednoho vzorku na BaseSpace Sequence Hub?
| Typ sekvenování | Cena | Detailní informace |
|---|---|---|
| Celo-genomové sekvenování | 7 iCredits | Vzorek: 30X WGS (homo sapiens) Velikost: 120Gb Aplikace: DRAGEN Germline Vstup: FASTQ Výstrup: VCF, BAM/CRAM |
| Celo-exomové sekvenování | 2 iCredits | Vzorek: Exom (homo sapiens) Velikost: 10Gb Aplikace: DRAGEN Enrichment Vstup: FASTQ Výstup: VCF, BAM/CRAM |
| Panel pro rakovinu | 2 iCredits | Vzorek: Myeloidní panel Velikost: 50 Mb Aplikace: DNA Amplicon Vstup: FASTQ Výstup: Somatické varianty |
| Celo-transcriptomové sekvenování | 2 iCredits | Vzorek: RNA-Seq Velikost: 50 Mb čtení Aplikace: DRAGEN RNA Vstup: FASTQ Výstup: RNA kvantifikace a detekce fúzí |
| Diferenciální exprese | 1 iCredit | Vzorek: Tumor Exom Velikost: 10 Gb Aplikace: RNA-Seq Differential Expression Vstup: FASTQ Výstup: PCA, Heatmap |
| RNA panel | 2 iCredits | Vzorek: RNA Panel Velikost: 3 million reads Aplikace: RNA Amplicon Vstup: FASTQ Výstup: Somatické varianty |
| 16S rRNA | 1-2 iCredits | Vzorek: 16S Metagenomika Aplikace: 16S Metagenomika Vstup: FASTQ Výstup: Taxonomické klasifikace |
Máte zájem o Professional nebo Enterprise účet na BaseSpace Sequnce Hub nebo potřebujete nakoupit iCredity? Kontaktujte nás.
Produktové materiály
