Panel pro detekci běžných respiračních virů (viz tabulka). Řešení je postavené na technologii Nextera Flex Enrichment, která umožňuje cíleně obohatit virové RNA a DNA fragmenty v analyzovaném vzorku. Bioinformatická analýza využívá Illumina Resequencing Analysis Module nebo IDbyExplify software. Resequencing Analysis Module se spustí automaticky po skončení sekvenačního experimentu, takže výsledky jsou k dispozici téměř ihned. IDbyExplify umožňuje detailní analýzu která zahrnuje kontrolu kvality, standardizaci, práci s ověřenými databázemi a upravení výsledného reportu dle přání uživatele.
Seznam virů detekovaných Respiratory Virus Oligos Panel
Human coronavirus 229E |
Human parainfluenza virus 1 |
Human coronavirus NL63 |
Human parainfluenza virus 2 |
Human coronavirus OC43 |
Human parainfluenza virus 3 |
Human coronavirus HKU1 |
Human parainfluenza virus 4a |
SARS-CoV-2 |
Human metapneumovirus (CAN97- 83) |
Human adenovirus B1 |
Respiratory syncytial virus (type A) |
Human adenovirus C2 |
Human Respiratory syncytial virus 9320 (type B) |
Human adenovirus E4 |
Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H1N1)) |
Human bocavirus 1 (Primate bocaparvovirus 1 isolate st2) |
Influenza A virus (A/ Korea/426/1968(H2N2)) |
Human bocavirus 2c PK isolate PK-5510 |
Influenza A virus (A/New York/392/2004(H3N2)) |
Human bocavirus 3 |
Influenza A virus (A/goose/ Guangdong/1/1996(H5N1)) |
Human bocavirus 4 NI strain HBoV4- NI-385 |
Influenza A virus (A/Zhejiang/DTID- ZJU01/2013(H7N9)) |
KI polyomavirus Stockholm 60 |
Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99(H9N2)) |
WU Polyomavirus |
Influenza A virus (A/ Texas/50/2012(H3N2)) |
Human parechovirus type 1 PicoBank/HPeV1/a |
Influenza A virus (A/ Michigan/45/2015(H1N1)) |
Human parechovirus 6 |
Influenza B virus (B/Lee/1940) |
Human rhinovirus A89 |
Influenza B virus (B/ Wisconsin/01/2010) |
Human rhinovirus C (strain 024) |
Influenza B virus (B/ Brisbane/60/2008) |
Human rhinovirus B14 |
Influenza B virus (B/ Colorado/06/2017) |
Human enterovirus C104 strain: AK11 |
Influenza B virus (B/ Washington/02/2019) |
Human enterovirus C109 isolate NICA08-4327 |
Human control genes |