Systém NextSeq 2000 je vysoko kapacitní stolní sekvenátor, který díky více než 75 průlomovým inovacím, představuje nejflexibilnější, cenově příznivý a v mnohých ohledech kvalitnější a jednoduší sekvenační systém pro řadu aplikací.
Inovace v podobě paternované flowcelly, modré 2 kanálové SBS technologie a optiky s vysokým rozlišením umožňují zvýšení hustoty dat, zvýšení kapacity, a naopak redukci sekvenačních nákladů. Na redukci sekvenačních nákladů a zjednodušení obsluhy systému se podílí i jednorázová integrovaná kazeta, která obsahuje všechny potřebné reagencie, kterých je v porovnání s dosavadními kazetami jiných sekvenátorů snížené množství, a taktéž je tato integrovaná kazeta uchovávaná v jednotných podmínkách. Kromě toho systém oddělení recyklovatelných částí kazety od tekutého odpadu umožňuje redukci nákladů pro likvidaci odpadu a celkově ekologičtější přístup.
Jedná se o první systém s integrovanou bioinformatickou platformou DRAGEN Bio-IT, která zkracuje dobu analýzy a usnadňuje pracovní postupy pro začínající i zkušené uživatele.
Shrnutí integrovaných postupů (pipelines) a s nimi související aplikace (je kompatibilní s řadou existujících knihoven) uvádí tabulka:
Integrovaný postup (pipeline) |
Aplikace |
Generovaní FastQ |
Demultiplexování a generování FastQ |
DRAGEN Enrichment |
Exom |
Cílené resekvenování |
|
DRAGEN RNA |
Transkriptom |
Detekce fúzí |
|
Dostupné v průběhu roku 2020 |
DNA/RNA panely |
Sekvenování single cell |
Sekvenátor NextSeq 2000 | ||||
Reagencie | Délka čtení (bp) | Výstup (Gb) | Doba experimentu (hod.) | Kvalita dat |
P2 reagencie | 2 × 50 | 40 | 13 | >85% >Q30 |
2 × 100 | 80 | 21 | >80% >Q30 | |
2 x 150 | 120 | 29 | >75% >Q30 | |
P3 reagencie (dostupné v Q4 2020) |
2 × 50 | 100 | 19 | >85% >Q30 |
2 × 100 | 200 | 33 | >80% >Q30 | |
2 × 150 | 300 | 48 | >75% >Q30 |
https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/nextseq-1000-2000.html