NovaSeq - Illumina

Systém NovaSeq 6000 představuje "state of the art" sekenátor založený na průlomových inovacích již ověřené technologie, nicméně je postaven zcela od základu jako nová technologie zahrnující přes 70 inovativních řešení. Uživateli umožňuje variabilitu a flexibilitu prakticky pro každý typ sekvenování, pro každý typ genomu a velikost projektu.

Enormní datový výstup je dán obrovským množstvím klastrů, které aby bylo možné vůbec zmapovat, je potřeba použití paternované neboli předdefinované flowcelly, kde klastry vznikají jen v jamkách jejich polohu si sekvenátor určí dle markerů na flow celle. Tím se sekvenování nejen zrychlí ale i zpřesní. Navíc téměř odpadá problém s stanovením nanášecí koncentrace knihovny, neboť systém je velmi odolný vůči "přeloudování". 

Paternované flowcelly:

Systém je vhodný pro aplikace vyžadující vysokou sekvenační kapacitu a zároveň i vysokou přesnot sekvenování.

Datový výstup a čas experimentu z jedné flowcelly (možné paralelní spuštění i 2 flowcell):

Použití:

WGS

WES

RNA Seq

Liquid biopsy

Agrigenomika 

https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/novaseq.html.

Související odkazy

MiniSeq - Illumina

Nejjednodušší stolní sekvenátor

MiSeq - Illumina

Sekvenování dostupnější než kdy jindy

MiSeq FGx

NGS systém pro forenzní aplikace.

NextSeq 550 - Illumina

Kombinace skeneru čipů a vysokokapacitního sekvenátoru

Software pro NGS

Bioinformatická analýza a vyhodnocení dat