NovaSeq - Illumina

Systém NovaSeq 6000 představuje "state of the art" sekenátor založený na průlomových inovacích již ověřené technologie, nicméně je postaven zcela od základu jako nová technologie zahrnující přes 70 inovativních řešení. Uživateli umožňuje variabilitu a flexibilitu prakticky pro každý typ sekvenování, pro každý typ genomu a velikost projektu.

Enormní datový výstup je dán obrovským množstvím klastrů, které aby bylo možné vůbec zmapovat, je potřeba použití paternované neboli předdefinované flowcelly, kde klastry vznikají jen v jamkách jejich polohu si sekvenátor určí dle markerů na flow celle. Tím se sekvenování nejen zrychlí ale i zpřesní. Navíc téměř odpadá problém s stanovením nanášecí koncentrace knihovny, neboť systém je velmi odolný vůči "přeloudování".

Paternované flowcelly:

Patterned Flow Cell Technology

Systém je vhodný pro aplikace vyžadující vysokou sekvenační kapacitu a zároveň i vysokou přesnot sekvenování.

Datový výstup a čas experimentu z jedné flowcelly (možné paralelní spuštění i 2 flowcell):

NovaSeq sekvenátor
Typ Flow Cell	SP	S1	S2	S4
Počet drah na flow cell	2	2	2	4
2 × 50 bp	65–80 Gb	134–167 Gb	333–417 Gb	N/A ^‡
2 × 50 bp	~13 hr	~13 hr	~16 hr	N/A
2 × 100 bp	134–167 Gb	266–333 Gb	667–833 Gb	1600–2000 Gb
2 × 100 bp	~19 hr	~19 hr	~25 hr	~36 hr
2 × 150 bp	200–250 Gb	400–500 Gb	1000–1250 Gb	2400–3000 Gb
2 × 150 bp	~25 hr	~25 hr	~36 hr	~44 hr
2 × 250 bp	325-400 Gb	N/A ^‡	N/A ^‡	N/A ^‡
2 × 250 bp	~38 hr	N/A	N/A	N/A

Použití:

WGS

WES

RNA Seq

Liquid biopsy

Agrigenomika

https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/novaseq.html.

NovaSeq - Illumina

Související odkazy

MiniSeq - Illumina

MiSeq - Illumina

MiSeq FGx

NextSeq 550 - Illumina

Software pro NGS

Vyžádat informace o:

NovaSeq