•  
  • Řešení
  • Produkty
    Přístroje
    • Příprava NGS knihoven
    • NGS sekvenátory
    • Microarrays
    • Automatické pipetovací systémy
    • Automatická extrakce NK
    • Prostorová transkriptomika
    • Singel-cell
    Kity a reagencie
    • Sekvenační kity
    • Kity pro přípravu NGS knihoven
    • Long-Read Technologie
    • Visium prostorová transkriptomika
    • Single cell 3‘ genová exprese
    • Ipsogen
    Nástroje pro analýzu dat
    • Profesionální sekundární analýza dat
    • Správa a analýza dat v cloudu
    • Interpretace variant v dědičných onemocněních
    • Interpretace variant v onkologii
    • NGS LIMS
  • Diagnostika
    Izolace NK
    • Izolace NK, automatická
    PCR
    NGS
    • TruSight Family
    • Respiratory Virus Oligo Panel
    • LymphoTrack
    • Celoexomové sekvenování (WES)
    • Celogenomové sekvenování (WGS)
    • Rychlé sekvenování celého genomu (rWGS)
    • VeriSeq NIPT Solution v2
    Ostatní metody
  • Firmy
    10x GENOMICS
    Arrow Diagnostics
    Covaris
    DNA Diagnostic A/S
    IAB
    Illumina
    Invivoscribe technologies
    LGC Biosearch Technologies
    Pillar Bioscience
    Quantum-Si
    Seer
    SeqOne Genomics
    Yourgene Health
  • Kontakty
    Obecný kontakt GeneTiCA GeneTiCA
    Produktová podpora Produktová podpora
    Aplikační podpora Aplikační podpora
    Technická podpora Technická podpora
    GeneTiCA Experience Centre GeneTiCA Experience Centre
  •  
    Genetica.CZGenetica.SKGenetica.HU
  •  
  •  
https://www.genetica.cz +420 272 701 055 Služeb 4 Praha
Úvod > Diagnostika > NGS > TruSight Family > TruSight Oncology 500

TruSight Oncology 500 - Illumina

TruSight Oncology 500 kit – Illumina

TruSight Oncology 500 je NGS panel, který umožňuje komplexní genomické profilování nádorů. Analyzuje DNA a RNA nádoru s cílem identifikovat klinicky významné genomové změny u širokého spektra nádorových onemocnění a přináší poznatky, které pomohou při rozhodování o nejvhodnější léčbě. Spolehlivě detekuje substituce bází, inzerce a delece, alterace počtu kopií, genové fúze a sestřihové varianty. Zároveň stanovuje nádorovou mutační nálož (TMB) a mikrosatelitovou nestabilitu (MSI), což jsou významné imunoterapeutické biomarkery.

Jediný test nahradí několik panelů pro jednotlivé biomarkery

  • Panel umožňuje analyzovat DNA a RNA
  • Analyzuje celkem 523 genů
  • Stanovuje nádorovou mutační nálož (TMB) a mikrosatelitovou nestabilitu (MSI)
  • Zahrnuje biomarkery obsažené v klíčových „guidelines“ pro nádorová onemocnění a klinických studiích

Efektivní postup od vzorku až po výsledný report

  • Pouze 4-5 dní od vstupního vzorku po výsledky analýzy
  • Možnost automatizace postupu – automatizační metody a kity již k dispozici
  • Analýza dat výrazně zrychlena díky Illumina platformě DRAGEN Bio-IT
  • Možnost využití interpretace dat pomocí softwaru PierianDx Clinical Genomics Workspace (CGW)

Poskytuje vysoce spolehlivé výsledky

  • Enrichementový přístup v kombinaci se sofistikovanou analýzou dat zajišťuje vysokou specificitu a senzitivitu
  • Využívá unikátní molekulární indexy (UMIs) ke zvýšení senzitivity detekce variant
  • Založen na osvědčené Illumina technologii sekvenace syntézou (SBS)

Komplexní genomické profilování nádorů přímo ve vaší laboratoři

  • Naprostá kontrola nad celou analýzou a získanými daty
  • Součástí panelu jsou i aktuální nově se objevující biomarkery

     

    Portfolio TruSight Oncology 500
    TruSight Oncology 500 TruSight Oncology 500 High-Throughput TruSight Oncology 500 ctDNA
    Analýza DNA a RNA izolované z FFPE vzorků nádorové tkáně. Analýza DNA a RNA izolované z FFPE vzorků nádorové tkáně. Umožňuje analýzu až 192 vzorků v jednom běhu.

    Analýza volné cirkulující nádorové DNA izolované nejčastěji z krevní plazmy.

     

 

 

 

  • TruSight Oncology 500
  • TruSight Oncology 500 High-Throughput
  • TruSight Oncology 500 ctDNA
  • Srovnání produktů TruSight Oncology 500
  • Tabulka klíčových biomarkerů
  • Illumina DRAGEN Bio-IT Platforma
  • Interpretace dat pomocí softwaru PierianDx Clinic

TruSight Oncology 500

 
Gene Count 523 genes for DNA, 55 genes for RNA
Content Specifications Targeted selection of DNA from 523 genes of interest, and RNA from 55 genes, for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Clinical Trials Coverage: Over 1,000 clinical trials
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: Biomarkers TMB and MSI included; also inclusive of HLA regions, POLE1 and POLD1*.
Sample Throughput 8 samples per run
Hands-On Time ~10.5 hours
Input Quantity 40 ng DNA, 40 ng RNA
Mechanism of Action Target Enrichment Workflow
Multiplexing Up to 8-plex
Analytical Specificity 99.9998% (for SNV detection)
Analytical Sensitivity > 96%
Variant Class Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Variants (SNVs), Transcript Variants
Method Target Enrichment, Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing
Cancer Type Pan-Cancer
Species Category Human
System Compatibility NextSeq 500, NextSeq 550, NextSeq 550Dx in Research Mode
Nucleic Acid Type DNA, RNA
Technology Sequencing
Automation Capability Liquid Handling Robots

* Na základě databáze PierianDx k březnu 2020. 

  Analýza DNA Analýza DNA + RNA

 

Dostupné produkty TruSight Oncology 500 pro manuální přípravu
Kit na přípravu knihovny a enrichement TruSight Oncology 500 DNA Kit
(48 vzorků)		 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle
(16 indexů, 24 vzorků)
Kit na přípravu knihovny a enrichement
+ sekvenační kit pro NextSeq		 TruSight Oncology 500 DNA Kit
for use with NextSeq
(48 vzorků)		 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle
for use with NextSeq
(16 indexů, 24 vzorků)
Kit na přípravu knihovny a enrichement
+ interpretace dat pomocí PierianDx		 TruSight Oncology 500 DNA Kit
plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 48 vzorků)		 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 24 vzorků)
Kit na přípravu knihovny a enrichement
+ sekvenační kit pro NextSeq
+ interpretace dat pomocí PierianDx		 TruSight Oncology 500 DNA Kit
for use with NextSeq
plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 48 vzorků)		 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle
for use with NextSeq
plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 24 vzorků)
  Analýza DNA Analýza DNA + RNA

 

Dostupné produkty TruSight Oncology 500 pro automatizaci přípravy
Kit na přípravu knihovny a enrichement TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit
(48 vzorků)		 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit
(16 indexů, 24 vzorků)
Kit na přípravu knihovny a enrichement
+ sekvenační kit pro NextSeq		 TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit for use with NextSeq
(48 vzorků)		 TruSight Oncology 500 DNA/RNA  Automation Kit for use with NextSeq
(16 indexů, 24 vzorků)
Kit na přípravu knihovny a enrichement
+ interpretace dat pomocí PierianDx		 TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 48 vzorků)		 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 24 vzorků)
Kit na přípravu knihovny a enrichement
+ sekvenační kit pro NextSeq
+ interpretace dat pomocí PierianDx		 TruSight Oncology 500 DNA Automation Kit
for use with NextSeq
plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 48 vzorků)		 TruSight Oncology 500 DNA/RNA Automation Kit for use with NextSeq
plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 24 vzorků)

TruSight Oncology 500 High-Throughput

 
Gene Count 523 genes for DNA, 55 genes for RNA
Content Specifications Targeted selection of DNA from 523 genes of interest, and RNA from 55 genes, for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Clinical Trials Coverage: Over 1,000 clinical trials
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: Biomarkers TMB and MSI included; also inclusive of HLA regions, POLE1 and POLD1*.
Recomended Sample Throughput 8 samples per run (S2 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage           24 samples per run (S4 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage
Hands-On Time ~10.5 hours
Input Quantity 40 ng DNA, 40-80 ng RNA (need at least 2 mm3 FFPE tissue)
Mechanism of Action Target Enrichment Workflow
Multiplexing 192 IDT for Illumina Nextera DNA UD Indexes (used for TSO500 HT DNA and RNA libraries)
Analytical Specificity 99.9998% (for SNV detection)
Analytical Sensitivity > 96%
Variant Class Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Variants (SNVs), Transcript Variants
Method Target Enrichment, Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing
Cancer Type Pan-Cancer
Species Category Human
System Compatibility NovaSeq 6000
Nucleic Acid Type DNA, RNA
Technology Sequencing
Automation Capability Liquid Handling Robots

* Na základě databáze PierianDx k březnu 2020.

TruSight Oncology 500 ctDNA

 

Tekutá biopsie – neinvazivní metoda pro detekci a monitorování nádorových onemocnění

  • Vysoká specificita a senzitivita umožňující detekci variant z krevní plazmy
  • Komplexní genomické profilování nádorů v případech, kdy nemáme k dispozici nádorovou tkáň
  • Monitorování vývoje onemocnění a účinku léčby
  • Rozsáhlý panel (1.94 Mb) je ideální pro určení mutační nálože nádoru (TMB) a mikrosatelitové nestability (MSI)

Nově je tento TruSight Oncology 500 ctDNA kompatibilní i s novou verzí sekvenačního kitu pro NovaSeq 6000 (v1.5).

 
Gene Count 523 genes for DNA
Content Specifications Targeted selection of 523 genes (full coding sequence) for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: TMB and MSI*
Sample Throughput 16–192 samples per flow cell
Hands-On Time ~10.5 hours
Input Quantity 30 ng cfDNA (8-10 ml of plasma)
Mechanism of Action Hybrid-capture chemistry
Multiplexing Up to 8 on S2, and 24 on S4 using Xp-4 Lane workflow, 16 indexes maximum
Analytical Specificity ≥ 99.995% (small variants, ≥ 0.5% VAF)
Analytical Sensitivity ≥ 95% (small variants, ≥ 0.5% VAF)
Method Target Enrichment, Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing
Variant Class Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Variants (SNVs), Somatic Variants
System Compatibility NovaSeq 6000
Species Category Human
Specialized Sample Types Blood, Cell-Free DNA
Technology Sequencing
Nucleic Acid Type DNA
Cancer Type Pan-Cancer

x* Na základě databáze PierianDx k březnu 2020. 

 

Dostupné produkty TruSight Oncology 500 ctDNA

 
Kit na přípravu knihovny a enrichement TruSight Oncology 500 ctDNA
(48 vzorků)
Kit na přípravu knihovny a enrichement
+ interpretace dat pomocí PierianDx		 TruSight Oncology 500 ctDNA
plus PierianDx interpretation report
(16 indexů, 48 vzorků)

Srovnání produktů TruSight Oncology 500

 

 

 

 

 TruSight Oncology 500 TruSight Oncology 500 High-Throughput TruSight Oncology 500 ctDNA 
Cancer Type Pan-Cancer Pan-Cancer Pan-Cancer
Content Specifications Targeted selection of DNA from 523 genes of interest, and RNA from 55 genes, for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Clinical Trials Coverage: Over 1,000 clinical trials
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: Biomarkers TMB and MSI included; also inclusive of HLA regions, POLE1 and POLD1*.		 Targeted selection of DNA from 523 genes of interest, and RNA from 55 genes, for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Clinical Trials Coverage: Over 1,000 clinical trials
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: Biomarkers TMB and MSI included; also inclusive of HLA regions, POLE1 and POLD1*.		 Targeted selection of 523 genes (full coding sequence) for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: TMB and MSI*
Hands-On Time ~10.5 hours ~10.5 hours ~10.5 hours
Input Quantity 40 ng DNA, 40 ng RNA 40 ng DNA, 40-80 ng RNA (need at least 2 mm3 FFPE tissue) 30 ng cfDNA (8-10 ml of plasma)
Method Target Enrichment , Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing Target Enrichment , Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing Target Enrichment , Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing
Nucleic Acid Type DNA, RNA DNA, RNA DNA
Specialized Sample Types FFPE Tissue FFPE Tissue Blood, Cell-Free DNA
Species Category Human Human Human
System Compatibility NextSeq 500 , NextSeq 550 , NextSeq 550Dx in Research Mode NovaSeq 6000 NovaSeq 6000
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
Variant Class Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Variants (SNVs), Transcript Variants Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Variants (SNVs), Transcript Variants

Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Variants (SNVs), Somatic Variants

 

 

 

* Na základě databáze PierianDx k březnu 2020.

 

Tabulka klíčových biomarkerů

TruSight Oncology 500 zahrnuje celkem 523 genů pro DNA část a 55 genů pro RNA část. Kompletní seznam najdete zde.

Detection of currently relevant DNA & RNA variants for multiple types of cancer. Some key biomarkers include:

Pan-Cancer Biomarkers:

NTRK1        NTRK2        NTRK3        MSI
Lung Melanoma Colon Ovarian Breast Gastric Bladder Sarcoma
AKT1 BRAF AKT1 BRAF AKT1 BRAF MSH5 ALK
ALK CTNNB1 BRAF BRCA1 AR KIT PMS2 APC
BRAF GNA11 HRAS BRCA2 BRCA1 KRAS TSC1 BRAF
DDR2 GNAQ KRAS KRAS BRCA2 MET   CDK4
EGFR KIT MET PDGFRA ERBB2 MLH1   CTNNB1
ERBB2 MAP2K1 MLH1 FOXL2 FGFR1 PDGFRA   ETV6
FGFR1 NF1 MSH2 TP53 FGFR2 TP53   EWSR1
FGFR3 NRAS MSH6   PIK3CA     FOXO1
KRAS PDGFRA NRAS   PTEN     GLI1
MAP2K1 PIK3CA PIK3CA         KJT
MET PTEN PMS2         MDM2
NRAS TP53 PTEN         MYOD1
PIK3CA   SMAD4         NAB2
PTEN   TP53         NF1
RET             PAX3
TP53             PAX7
TMB             PDGFRA
              PDGFRB
              SDHB
              SDHC
              SMARCB1
              TFE3
              WT1

* Produkt, který analyzuje DNA i RNA varianty se nazývá TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle.

 

Illumina DRAGEN Bio-IT Platforma – sekundární analýza dat 2-10x rychleji!

Jedna z možností provedení sekundární analýzy dat je pomocí softwaru DRAGEN.

V současné době k dispozici pro TruSight Oncology 500 ctDNA. Pro ostatní produkty portfolia TruSight Oncology 500 bude k dispozici začátkem roku 2021.

TruSight Oncology 500 Běžný server* DRAGEN server
Počet analyzovaných vzorků Doba trvání analýzy Doba trvání analýzy
8 vzorků tkáňové biopsie 5.5 hod. 2 hod.
16 vzorků tkáňové biopsie 12 hod. 3 hod.
32 vzorků tkáňové biopsie 18 hod. 5 hod.
72 vzorků tkáňové biopsie 24 hod. 10 hod.
24 vzorků tekuté biopsie (ctDNA) 216 hod. (9 dní!) 22 hod. (<1 den!)

*Časy se mohou lišit podle specifikace konkrétního serveru.

Více informací najdete na stránkách Illumina 

 

Interpretace dat pomocí softwaru PierianDx Clinic​

K získání výsledného reportu analýzy pomocí TruSight Oncology 500 je možnost využít software Pierian Dx CGW, který provádí analýzu pomocí rozsáhlé databáze vědeckých článků, informací o jednotlivých lécích a klinických studií. Stačí nahrát soubory dat z analýzy (BAM, FASTQ, VCF) a PierianDx CGW vytvoří přehledný report.

TruSight Oncology 500
Logo Illumina

Vyžádat informace o:

TruSight Oncology 500

Eliška Maršálková Oddělení zákaznické podpory Genetica s.r.o. +420 604 199 153 marsalkova@genetica-group.com Genetica s.r.o.


Kontaktní formulář

Údaje s hvězdičkou
jsou povinné
Copyright © 2025 GeneTiCA s.r.o. +420 272 701 055 | genetica@genetica.cz