Současná péče o onkologické pacienty je založena na testování mnoha biomarkerů. Konzervativní přístup testování po jednotlivých genech často vede k nedostatku tkáně pro další testy a je tedy potřeba maximálně využít omezené množství biopsie pacienta. TruSight Oncology Comprehensive (CE-IVD) je řešení pro komplexní genomické profilování (CGP), které konsoliduje řadu jednotlivých testů do jediného panelu, minimalizuje množství potřebného vzorku a maximalizuje schopnost potenciálně identifikovat mutace, které lze využít pro lepší výsledky pacientů.
TruSight Oncology Comprehensive je diagnostický test in vitro, který využívá NGS k detekci variant v 517 genech pomocí nukleových kyselin extrahovaných z FFPE vzorků od pacientů s nádorovým onemocněním. Test lze použít k detekci jednonukleotidových variant, vícenukleotidových variant, inzercí, delecí a amplifikací genů z DNA a genových fúzí a sestřihových variant z RNA. Test také uvádí skóre mutační zátěže nádoru (TMB) a stav mikrosatelitní nestability (MSI).
Jediný test nahradí několik panelů pro jednotlivé biomarkery
TruSight Oncology Comprehensive (CE-IVD)
Assay Time | 4-5 days |
Hands-On Time | ~10.5 hours |
Input Quantity | DNA: 40 ng genomic DNA; RNA: 40 ng total RNA; FFPE: minimum recommendation of 2 mm3 tissue, minimum 20% tumor cell content recommended, ≥ 30% optimal |
Content Specifications | Covers clinically relevant biomarkers across 28+ solid tumors included in 64 clinical guidelines, 111 drug labels, and 615+ clinical trials. Panel content: 517 genes for small variants, 23 genes for fusions, 2 genes for splice variants (MET, EGFR), 2 genes for amplifications (ERBB2, MET), TMB and MSI. |
Sample Throughput | Up to 7 patients and 2 controls (1 positive and 1 NTC) samples per sequencing run |
False Positives by DNA variant type |
|
False Positive Rate by RNA Variant Type |
|
Method | Target Enrichment, Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing |
System Compatibility | NextSeq 550Dx |
Nucleic Acid Type | RNA, DNA |
Species Category | Human |
Technology | Sequencing |