Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit (UPIP) - Illumina

Infekce močových cest jsou jednou z nejběžnějších bakteriálních infekcí způsobených Gram-pozitivními, ale i Gram-negativními bakteriemi. Tyto bakterie a další uropatogeny většinou osidlují dolní močové cesty, a častěji se vyskytují u žen. Překážkou úspěšné léčby je zvyšující se procento antimikrobiální rezistence mezi uropatogeny.

Urinary Pathogen Panel (UPIP) pomáhá kompletně identifikovat profil infekce, včetně bakterií, hub, virů a parazitů a také širokou škálu markerů antimikrobiální rezistence. UPIP tak umožňuje komplexní detekci a kvantifikaci běžných, ale i obtížně kultivovatelných a mnohdy vynechávaných uropatogenů. Protokol testu je založen na NGS technologii s enrichmentovým přístupem. To znamená, že  pomocí speciálně navržených prób jsou vychytávány cílové oblasti genomu z celkové izolované DNA vzorku. Následné sekvenování NGS knihoven probíhá na Illumina sekvenátorech. Doporučené pokrytí je 1 milion čtení na vzorek, tím pádem je vhodná již nízkokapacitní sekvenační platforma MiniSeq (Illumina), popřípadě MiSeq (Illumina). Analýza sekvenačních dat probíhá pomocí aplikace Explify UPIP od IDbyDNA.

Více informací naleznete na stránkách výrobce