EmbryoMap je řešení pro preimplantační genetickou diagnostiku aneuploidií a strukturních chromozomových změn (PGT-A a PGT-SR) vyvinuté firmou Vitrolife. Nahradil a vylepšil původní řešení VeriSeq PGS od firmy Illumina. Nový EmbryoMap umožnuje rychlejší a snazší zpracování vzorku, přesnější detekci celo- i sub-chromozomových změn a analýzu pomocí speciálně vyvinutého software.
V nabídce jsou varianty pro:
8 vzorků (kat. č. 13308)
12 vzorků (kat. č. 13312)
24 vzorků (kat. č. 13324)
48 vzorků (kat. č. 13348)
PŘÍPRAVA VZORKU A SEKVENOVÁNÍ
Součástí kitu jsou reagencie na kompletní přípravu vzorku od izolace DNA a přípravu knihovny po samotnou sekvenační flowcellu pro Illumina MiSeq system. Vstupním materiálem je biopsie z trofoektodermu embrya.
Celé hands-on workflow je možné stihnout během 5 hodin, následně probíhá sekvenace a druhý den je možné analyzovat výsledky. Velkou výhodou jsou tzv. stopping points, ve kterých je možné vzorky v průběhu přípravy zamrazit a pokračovat ve zpracování později.
ANALÝZA
Analýza probíhá pomocí cloudového software eMap, vytvořeného speciálně pro EmbryoMap. eMap je určený k naplánování celého sekvenačního běhu, sledování vzorku, automatické nahrání dat ze sekvenátoru a automatickou analýzu a report. Navíc umožnuje personalizaci samotnou laboratoří mimo jiné v zobrazení dat nebo nastavení prahových hodnot (treshold).
Typ vzorku |
Biopsie embrya, trofoektoderm |
Počet vzorků |
8, 12, 24 nebo 48 |
Technologie |
NGS, paired-end reads |
Přístroj |
Illumina MiSeq system |
Obsah kitu |
Reagencie pro přípravu vzorku (izolace, knihovna), sekvenační flowcelly |
Software |
eMap (součástí řešení) |
Katalogové číslo |
13308; 13312; 13324; 13348 |